Mi Servidor Dedicado corriendo Fedora Core 2 - chmod sólo un d

Tengo un servidor dedicado. Su corriendo Fedora Core 2 y Plesk. Sólo tengo una dirección IP. Tengo un cliente con cinco dominios.
¿Cómo puedo cambiar los permisos de archivo de uno de estos dominios? Im usando Putty SSH a mi servidor (utilizando la dirección IP) y la tala de árboles en general utilizando mi nombre de usuario y contraseña. ¿Qué es exactamente el comando para cambiar la raíz de archivo permisos de archivo para un solo dominio.

Cuando sólo tengo un dominio y una dirección IP, me tendría que escribir:
CHMOD 744-a
o chmod 755 <filename>

Pero Im confundido ahora con los múltiples dominios. Todo el mundo sabe exactamente lo que necesito para escribir cuando me conectado a mi servidor?